7 équipes rejoignent le programme BOAS et contribuent à la science ouverte

Développer un algorithme est une première étape. Le documenter, le rendre réutilisable et le partager avec l'ensemble de la communauté en est une autre. C'est l'ambition du programme Bibliothèque ouverte d'algorithmes en santé (BOAS), qui a le plaisir d'annoncer de l’accompagnement de 7 nouveaux projets. Les équipes ont été retenues sur recommandation d’un jury composé d’une dizaine d’experts indépendants et bénéficieront de l’accompagnement humain, technique et financier de la Plateforme des données de santé (PDS). Les nouveaux lauréats contribueront à enrichir le patrimoine commun de ressources open source de la recherche en santé.

Transformer des développements en ressources réutilisables

Dans de nombreux projets de recherche, des outils sont développés pour répondre à un besoin précis : identifier une population de patients, structurer des données hospitalières ou encore automatiser certaines analyses. Ces développements, pourtant précieux et chronophages, restent trop souvent cantonnés à la finalité du projet de recherche initial.

La Bibliothèque Ouverte d'Algorithmes en Santé (BOAS) a été créée pour valoriser ces travaux. En accompagnant les porteurs de projets dans la documentation, la consolidation et la diffusion de leurs outils, la PDS favorise leur réutilisation par l'ensemble de la communauté scientifique. Les équipes sélectionnées rejoignent ainsi les 40 projets déjà accompagnés.

7 projets au service de la communauté

Les projets retenus illustrent la diversité des usages des données de santé.

Faciliter l'exploitation des données de santé issues du SNDS

• openSNDS2vec – DREES : développer un outil facilitant la construction de variables d'analyse métier dans le SNDS afin d'accélérer les travaux de recherche, faciliter les dépistage et améliorer leur précision.
• H-INSIGHT-STROKE – Université de Bordeaux : développer un algorithme permettant d’estimer et mieux suivre le handicap pouvant résulter d'un AVC à partir des données de la base principale SNDS.

Structurer et améliorer les données hospitalières

• Onco-BERT-BOAS – Centre Léon Bérard : structurer automatiquement les comptes rendus médicaux issus d’EDS hospitaliers en cancérologie.
• IMAGE-QC – CHRU de Nancy : standardiser les données d'imagerie médicale à partir d’examens bruts issus du soin courant afin d’obtenir automatiquement des cohortes exploitables en recherche médicale..
• ANAPOCR – Hôpital Européen de Marseille : extraire des données textuelles à partir d’images d’anatomopathologie scannées afin de les rendre directement exploitables.

Développer de nouveaux outils d'aide à la recherche

• GLIMPSE – CHU d'Angers : développer un outil d'intelligence artificielle pour mieux stratifier le risque d'évolution de certaines maladies du sang, grâce à l'exploitation de données biologiques et cliniques.
• ESC-SCORE2-EDSH – CHU de Limoges : développer et valider un outil permettant de stratifier automatiquement le risque cardiovasculaire à partir des données d'un entrepôt de données de santé.

Une bibliothèque collaborative, peuplée par et pour la communauté de la recherche en santé

En partageant leurs outils en open source, ces équipes contribuent à faire de la BOAS un véritable patrimoine commun au service de la recherche et de l'innovation en santé. La bibliothèque rassemble aujourd'hui près de 50 ressources documentées et réutilisables, permettant aux chercheurs de s'appuyer sur des outils existants plutôt que de les redévelopper.