IMMUCANE

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Ce projet répond à un enjeu majeur de santé publique : mieux comprendre la biologie des cancers dans toute leur complexité, en intégrant les caractéristiques intrinsèques des tumeurs, leurs interactions avec l’environnement local et systémique, ainsi que leur évolution sous traitement, afin d’améliorer la prise en charge des patients.

Malgré les avancées thérapeutiques, notamment en oncologie de précision, la variabilité de réponse aux traitements (chimiothérapie, thérapies ciblées, immunothérapies) demeure importante. Cette hétérogénéité reflète la diversité des mécanismes biologiques impliqués, incluant les altérations génomiques, les programmes transcriptionnels, les états cellulaires, l’organisation du microenvironnement tumoral, ainsi que les dynamiques systémiques observables dans le compartiment périphérique. Une approche intégrative multi-échelles constitue un levier essentiel pour affiner la stratification des patients, optimiser les stratégies thérapeutiques et limiter l’exposition à des traitements inefficaces.

L’objectif principal de cette étude est de décrypter les déterminants biologiques de l’évolution tumorale et de la réponse aux traitements, en intégrant de manière conjointe les caractéristiques intrinsèques de la tumeur et ses interactions avec son environnement local et systémique.

Plus spécifiquement, les objectifs sont :

-de caractériser les propriétés intrinsèques des tumeurs (altérations génomiques, transcriptomiques, épigénétiques, hétérogénéité intra-tumorale),
-d’analyser le microenvironnement tumoral dans ses différentes composantes cellulaires, moléculaires et fonctionnelles,
-d’étudier les interactions entre la tumeur et le compartiment périphérique à travers l’analyse intégrée de biomarqueurs circulants, d’acides nucléiques circulants et de populations cellulaires sanguines, incluant l’impact de l’Hématopoïèse clonale sur les signatures observées,
-d’identifier des signatures biologiques associées à la réponse, à la résistance et à la progression tumorale,
et de contribuer au développement de stratégies de médecine de précision fondées sur des approches intégratives multi-omiques et multi-échelles.

Sur le plan méthodologique, il s’agit d’une étude observationnelle reposant sur l’exploitation secondaire de données issues du soin courant. Les données analysées incluent :

-des données cliniques (caractéristiques des patients, type de cancer, traitements reçus, évolution, survie et événements associés),
-des données issues d’échantillons tumoraux (analyses histologiques, génomiques, transcriptomiques, épigénétiques, protéomiques et spatiales),
-des données issues de prélèvements sanguins permettant l’étude du compartiment périphérique, incluant :
-l’analyse d’acides nucléiques circulants (ADN tumoral circulant, ARN circulant),
-l’étude de biomarqueurs moléculaires et protéiques circulants,
-l’analyse de populations cellulaires sanguines, notamment les cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC),
ainsi que, de manière plus générale, toute analyse cellulaire, moléculaire ou fonctionnelle du compartiment sanguin périphérique,
incluant la détection d’altérations liées à l’hématopoïèse clonale susceptibles d’interférer avec l’interprétation des profils moléculaires.

Les analyses reposent sur des approches intégratives combinant données cliniques et multi-omiques, incluant des approches à haute résolution telles que les analyses unicellulaires, spatiales et longitudinales, afin d’identifier des corrélations entre les caractéristiques biologiques des tumeurs, leur environnement et les trajectoires cliniques des patients. Une attention particulière sera portée à la distinction entre altérations tumorales et altérations issues de l’hématopoïèse clonale, ainsi qu’à leur impact sur l’interprétation des données de biopsie liquide, les mécanismes de résistance et la stratification des patients.

Les données sont pseudonymisées conformément à la réglementation en vigueur, et aucun recueil de données génétiques constitutionnelles identifiantes n’est réalisé.

La population d’étude comprend des patients atteints de cancer pris en charge à Gustave Roussy, pour lesquels des données cliniques et des échantillons biologiques sont disponibles dans le cadre du soin. L’étude est non interventionnelle et n’implique aucune modification de la prise en charge des patients.

Ce projet vise à générer des connaissances nouvelles sur les déterminants multifactoriels de la progression tumorale et de la réponse thérapeutique, avec un impact attendu sur l’identification de biomarqueurs, l’optimisation des stratégies thérapeutiques et, à terme, l’amélioration du pronostic des patients atteints de cancer.