Evaluation de la performance d’un modèle de classification des séjours pour le PMSI à partir des dossiers médicaux
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Ce projet de recherche vise à évaluer les performances des outils open source disponibles permettant la classification des séjours pour le codage PMSI à partir des éléments des dossiers. Cela nécessitera d’adapter et tester les modèles existants afin de déterminer le niveau de performance de chacun sur les données de l’EDS en les comparant à la classification des diagnostics déjà réalisée par les services cliniques et le service d’information médicale. Ces données couvrent la période de création des documents intégrés dans l’EDS.
L'objectif est d'évaluer la performance des modèles de classification des diagnostics des séjours de disponibles en open source, à partir des données de l’EDS.
Méthode : Le problème proposé est celui de la classification multi-étiquettes (un diagnostic principal, des diagnostic secondaires) de comptes-rendus médicaux par des codes dans un très large espace et inégalement distribués. Cette classification doit, de plus, être interprétable par un humain.
Dans la littérature les modèles encodeurs avec mécanisme attention sont les plus populaires. Ils ne peuvent cependant offrir des performances suffisantes que sur les codes les plus fréquents. En complément des solutions basées sur la similarité d’un document par rapport aux concepts médicaux ont été proposées. Des modèles s’appuyant sur la hiérarchie et la co-occurrence des codes peuvent également permettre une amélioration. Toutefois, les systèmes complètement autonomes restent trop limités. Les outils de collaboration homme / machine apparaissent comme la solution utilisable en production, améliorant la qualité du codage et diminuant le temps d’annotation par un opérateur. Nous proposons ainsi d’élaborer un système de recommandation du codage des diagnostics.
Population d'étude : Critères d’inclusion
Seront inclus tous les patients ayant eu un séjour d’hospitalisation entre 2013 et 2025 (date de sortie d’hospitalisation) avec un passage dans l’un des trois services du site de Poitiers du CHU suivants : orthopédie (incluant la chirurgie de la colonne), oncologie médicale ou les urgences. Concernant le troisième service (UHCD), seront inclus uniquement les séjours mono-urgences adultes, c’est-à-dire, n’ayant que des passages unités avec autorisation 07A (urgences générales).
Critères de non inclusion
Ne seront pas incluses dans l'étude les hospitalisations pour séances (GHM 28), cette activité étant actuellement codée de manière automatisée en grande partie. Ne seront également pas inclus les patients ayant exercé leur droit d’opposition à la réutilisation de leurs données dans l’EDS du CHU de Poitiers.
Période d’inclusion ou de ciblage : du 01/01/2013 au 31/12/2025
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
2
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
-Envoi par mail de la note d’information générale de la constitution de l’EDS et de la
réutilisation des données a des fins d’étude, évaluation et recherche, les patients sont
informés via portail de transparence
-Information mentionnée dans les comptes rendus de consultation et d’hospitalisation
L’ensemble des moyens d’information retenus ont pour objectif de donner la possibilité
aux participants de faire valoir leurs droits. Une information sera également relayée pour
chaque réutilisation des données, dont le présent projet, à travers un portail de
transparence dématérialisé qui précisera pour chaque étude : le responsable de
traitement, la finalité du projet, le rappel du droit d’accès, de rectification, d’effacement
ou de limitation des données ainsi que le contact du délégué à la protection des données
(DPO) et de l’investigateur pour faire valoir ces droits.
Les patients sont également informes qu'ils peuvent saisir la CNIL.