Etude phylogénétique du virus Chikungunya circulant dans l’Océan Indien IOR – CHIKV .
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Analyser la phylogénétique du virus du chikungunya circulant actuellement dans l'Océan Indien permettrait de mieux comprendre la réémergence de ce virus ainsi que la cinétique de l’épidémie.
Le but de l’étude est d’analyser l’évolution génétique du virus du chikungunya circulant actuellement dans la région de l’Océan Indien ce qui permettra de mieux comprendre la réémergence de ce virus ainsi que sa circulation.
Le projet concerne utilisation les reliquats de sang du soin et les données des personnes infectées par le virus et prises en charge au Centre Médical de l'Institut Pasteur ainsi dans les centres de surveillances des maladies tropicales en Europe et Canada .
Une analyse descriptive des données cliniques avec médiane et intervalle interquartile pour les variables continues et proportions pour les variables catégorielles sera réalisée. Le génome viral sera séquencé en NGS et le maximum de vraisemblance pour la phylogénie sera déterminé.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
Analyse descriptive des données cliniques avec médiane et intervalle interquartile pour les variables continues et proportions pour les variables catégorielles.
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
15
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
- Un modèle de MTA avec chacun des centres fournisseurs (basés en UE ou au Canada) du réseau GeoSentinel et TropNet
o S’agissant des centres en Union Européenne, on prévoit une annexe RGPD classique
o S’agissant des centres basés au Canada, mise en place les clauses type de transfert de la Commission Européenne
Concernant le partage de données avec ISTM (International Society of Travel Medicine) étant basé aux États-Unis :
o mise en place les clauses type de transfert de la Commission Européenne
Droits des personnes
- Information individuelle des patients, des usagers : Note d’information spécifique au projet envoyée par mail ou transmise par médecin aux sujets, possibilité d’exprimer son opposition par retour de mail ou en contactant le dpo de l’Institut Pasteur. Cette note d’information contient un lien vers une page web de l’étude où cette note d’information se trouve et où les résultats globaux de l’étude seront communiqués.
- Les patients infectés par le Chinkungunya venant pour diagnostic aux centres de références des maladies tropicales inclus dans ce projet sont informés lors de leur venue que leurs échantillons et leurs données peuvent être réutilisés pour des recherches ultérieures. Ces patients ont eu un prélèvement qui a été réalisé pour le diagnostic et dont le reliquat ainsi que quelques données issues du soin seront utilisés pour l’étude IOR-CHIKV s’ils ne s’y s’opposent pas.