Etude par transcriptomique spatiale de lésions pré-néoplasiques de peau humaine : étude de faisabilité

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Intérêt pour la santé publique:
L’étude de faisabilité a pour objectif de déterminer l’intérêt de réaliser dans le futur une étude sur un plus grand nombre d’échantillons : cette future étude aura pour objectif de déterminer si la transcriptomique spatiale pourrait être utilisée pour optimiser le diagnostic des kératoses actiniques (KA) c’est-à-dire compléter l’histologie pour définir si une KA présente un potentiel évolutif ou un potentiel de régression et ainsi adapter le suivi du patient.

L’objectif de l’étude de faisabilité PreneoPeau, ancillaire à l’étude SpectroLive, est d’évaluer la faisabilité de la caractérisation par transcriptomique spatiale de lames histologiques de peau humaine c’est à dire d’évaluer si les ARNm présents sur les lames histologiques sont exploitables et si les informations issues de l’étude PreneoPeau réalisée par transcriptomique spatiale seront corrélées aux résultats de l’étude SpectroLive réalisée sur puces (Dubois-Pot-Schneider et al., Int J Mol Sci, 2023).

Méthodologie:
• Sélection des lames histologiques par le CRAN selon la pertinence évaluée lors de l’étude transcriptomique réalisée sur puce (SpectroLive NCT0295626, ID-RCB: 2016-A00608-43)
• Recherche des lames histologiques dans les archives par le service d’anatomopathologie du CHR MT
• Réalisation de lames histologiques et envoi des lames histologiques par le CHR MT au CRAN (via la navette quotidienne entre CHR MT et CHRU de Nancy) pour mesure de la qualité des ARNm (RIN : RNA integrity number)
• Envoi des blocs histologiques (à température ambiante) par le CHR MT à la plateforme Genomeast
• Etude transcriptomique sur les blocs de paraffine par la plateforme Genomeast et envoi des données au CRAN
• Analyse des données par le CRAN en collaboration avec la plateforme Genomeast
• Envoi du résultat des analyses par le CRAN aux partenaires : Cancéropôle Est et CHR MT.

Population : patient présentant un carcinome épidermoïde et kératose actinique