Bactériémies à Escherichia coli chez l’Homme et facteurs associés à la pathogénicité et à la virulence. - COLISEP

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Nous avons trois objectifs spécifiques de cette étude:
(i) Déterminer les facteurs de risque cliniques et microbiologiques associés au décès dans les bactériémies à E. coli dans le nouveau contexte épidémiologique de l'augmentation des souches productrices de BLSE à la fois dans la communauté et à l’hôpital en France. Ces facteurs de risque seront comparés à ceux de l'étude COLIBAFI 2005 et SEPTICOLI 2016.
(ii) Déterminer l’épidémiologie moléculaire des souches de E. coli responsables de bactériémies en France en 2023 et les comparer aux souches de 2005 et 2016 ainsi qu’aux souches commensales d’études précédentes de notre groupe (étude COLIVILLE et ERC EVE en cours).
(iii) Comparer les caractéristiques génomiques des souches de E. coli avec d’autres collections mondiales, afin d’aider à la détermination des sérotypes cibles pour l’élaboration de vaccins.
Le but ultime est d'avoir un impact sur la gestion clinique des patients, par la compréhension des déterminants de la gravité des patients dans le contexte des grands changements épidémiologiques.

Etude rétrospective observationnelle, incluant 500 adultes souffrant de bactériémies à E. coli hospitalisés dans l'un des 6 hôpitaux de l’APHP participant. Des données cliniques précises seront recueillies sur données des dossiers informatisés à l'inclusion (le jour de positivité de la première hémoculture) et 28 jours après l'inclusion ou le jour de la sortie du patient de l’hôpital (si avant le jour 28).