Variants NR5A1 altérant l'épissage dans les DSD 46,XY : Leçons des analyses in vitro et ex vivo (SPLICXY)

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Introduction

Les variants pathogènes NR5A1 sont responsables d'un large spectre de phénotypes, incluant les Variations du Développement Génital (VDG) chez les individus 46,XY, allant d'une sous-virilisation mineure à une inversion sexuelle avec dysgénésie gonadique complète (Kouri et al., 2024). Leur diagnostic moléculaire est crucial pour fournir des soins médicaux appropriés et anticiper au mieux le degré de virilisation à la puberté et de fertilité. L'identification de variants dans les gènes VDG, qui incluent plus de trente gènes bien connus pour les formes isolées et plus d'une centaine pour les formes syndromiques, est maintenant facilement accessible grâce au séquençage ADN haut débit (Ea et al., 2021). Cependant, l'interprétation des variants reste difficile. Elle implique initialement des prédictions in silico et l'analyse de données épidémiologiques utilisant des bases de données de variants (Baux et al., 2021). Les tests fonctionnels in vitro et ex vivo, réalisés dans le cadre du soin, sont de plus en plus requis pour déterminer de manière concluante leur pathogénicité (Buisine et al., 2025). L'impact pathogène des variants affectant l'épissage du gène NR5A1 est actuellement sous-estimé (Laan et al., 2021), du fait du manque de réalisation des tests fonctionnels dans les laboratoires de diagnostic.

Objectif principal
Confirmer l'impact pathogène, prédit par des outils de bioinformatique, de 5 nouveaux variants de NR5A1, par 2 techniques : essais minigène (in vitro, avec reconstruction du variant sans matériel biologique du patient, pour les 5 variants) et séquençage ARN (RNA-seq) des transcrits NR5A1 (ex vivo, uniquement pour le patient P2A, analyse réalisée dans le cadre du soin).