Séro-épidémiologie des Orthobunyavirus en Guyane - SerOBHAG
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Ce projet vise à améliorer les connaissances sur le genre Orthobunyavirus (OBV) en Guyane, véritable réservoir de candidats à une émergence future. Une cartographie de la séroprévalence OBVs chez l’homme et dans la faune sauvage réalisée à l’aide d’une technique innovante de sérologie haut débit (MIA) ciblant les principaux groupes antigéniques d’OBV, permettra de préciser la diversité des OBV circulants, leurs réservoirs potentiels ainsi que leurs zones de transmission préférentielles.
Les résultats obtenus permettront en effet d’estimer la proportion de personnes déjà infectées par un OBV en précisant les tranches d’âge ainsi que les zones géographiques les plus à risque, et le cas échéant de reconstituer l’historique d’éventuelles épidémies survenues sur le département de la Guyane. Ils nous permettront également d’apprécier la diversité des OBV circulants sur le territoire.
Ce projet revêt donc un caractère d’intérêt public majeur, en répondant aux thématiques de caractérisation d’agents pathogènes circulants encore méconnus et de compréhension des phénomènes épidémiques et/ou de risques d’émergence en Amazonie. Il permettra de contribuer au développement de nouveaux outils diagnostiques jusqu’ici inexistants, mais indispensables à un meilleur contrôle et une meilleure prévention des risques d’émergences.
Enfin, en venant améliorer les connaissances et les outils de détection des OBV, ce projet fournira des éléments clefs pour le renforcement et l’orientation des stratégies de santé publique relatives à la prévention, à la prise en charge des infections ainsi qu’au contrôle des émergences susceptibles d’apparaître dans les prochaines années.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)
données recueillies dans le cadre de recherches type RIPH2
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
L'utilisation de cette donnée est nécessaire pour atteindre les objectifs de la recherche :
préciser la diversité des Orthobunyavirus (OBV) circulants (arbovirus), leurs réservoirs potentiels ainsi que leurs zones de transmission préférentielles en Guyane, à travers la cartographie de la séroprévalence OBVs chez l’homme et dans la faune sauvage avec :
- le développement d’un outil innovant de sérologie haut débit – MIA adapté à la détection des infections par les Orthobunyavirus.
- l’évaluation de la circulation et la distribution des OBVs en Guyane, à travers l’étude de la séroprévalence des anticorps anti OBV dans la population générale humaine et au sein de la faune sauvage.
- la modélisation des niches écologiques des OBVs.
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement
Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
15
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Les échantillons et les données proviendront des deux cohortes suivantes :
- La collection EPI-ARBO (collection déclarée auprès du MESRI DC-2018-3336-Col2), constituée en 2017 dans le cadre du projet EPI-ARBO (Séro-épidémiologie des arboviroses prioritaires en Guyane), visant à évaluer la séroprévalence des arbovirus (flavi et alphavirus) dans la population guyanaise, et approuvé par le Comité de Protection des Personnes "Sud-Ouest & Outre-Mer IV" (n° CPP17-007a/2017-A00514-49 du 01/06/2017).
- La collection « EPI-COVID-POP », (collection déclarée auprès du MESRI DC-2023-5844), constituée en 2021 à l’issue de l’étude du projet EPI-COVID-POP (Étude de séroprévalence du COVID-19 en Guyane (RIPH Promotion IP)), et approuvé par le Comité de Protection des Personnes Est III (n°CPP : 20.07.04, n° CNRIPH : 20.06.2664431, n° ID-RCB : 2020.A01826-33 du 10/07/2020). La collection EPI-ARBO (collection déclarée auprès du MESRI DC-2018-3336-Col2), constituée en 2017 dans le cadre du projet EPI-ARBO (Séro-épidémiologie des arboviroses prioritaires en Guyane), visant à évaluer la séroprévalence des arbovirus (flavi et alphavirus) dans la population guyanaise, et approuvé par le Comité de Protection des Personnes "Sud-Ouest & Outre-Mer IV" (n° CPP17-007a/2017-A00514-49 du 01/06/2017).
La présente demande de dérogation à l’information ne concerne que la réutilisation des échantillons et des données de la cohorte EPI-COVID-POP réalisée pour l’étude de prévalence du COVID-19.
L’utilisation des échantillons de la cohorte EPI-ARBO constituée pour l’étude séro-épidémiologique des arboviroses se fait dans le cadre des objectifs initiaux de cette cohorte dont les échantillons et les données sont conservés 15 ans conformément au protocole. Cette utilisation ne fait donc pas l’objet de la demande de dérogation.
Dans les documents d’information associés au projet EPI-COVID-POP était mentionné que le reliquat des prélèvements serait conservé en collection (biothèque) au sein du laboratoire de virologie de l’Institut Pasteur de Guyane sous la responsabilité du Dr Dominique Rousset, médecin biologiste, jusqu’à ce que tous les échantillons aient été utilisés, et que ces collections seraient ouvertes à la communauté scientifique, en priorité pour des travaux de recherche portant sur des virus similaires.
Dans le formulaire de consentement était mentionné : "J’ai compris que, sauf opposition de ma part, ces mêmes données pourront être transmises ultérieurement à des équipes scientifiques internationales académiques ou industrielles à des fins strictement nécessaires de recherche scientifique dans le domaine de l’infectiologie ou l’épidémiologie et dans un objectif d’intérêt public ». Pour ces deux collections, les consentements des participants signés pour la réutilisation de leurs échantillons et de leurs données dans le contexte de futurs projets de recherche sont donc disponibles.
Seules les données nécessaires et suffisantes à l’étude SerOBHAG (âge, sexe et commune de résidence) seront extraites de la base de données de l’étude d’origine et aucune donnée directement identifiante ne sera transmise, puisqu’inutile pour l’étude et que, comme mentionné plus haut, le rendu des résultats aux participants n’est pas envisagé (problèmes de perdus de vue (coordonnées invalides) et absence de conséquence médicale pour le patient).
Compte tenu du délai depuis lequel les participants ont été inclus (2021), et de la possibilité que certains participants soient perdus de vue, l’information individuelle du participant inclus dans la recherche n’est pas possible. En effet, compte tenu du nombre de retours de courriers non distribués (environ 40%) parmi les envois des résultats pourtant réalisés dans les 6 mois ayant suivi la collecte des prélèvements, il est très peu probable que l’on réussisse après plusieurs années à recontacter une proportion significative des participants.
Il est à noter que l’étude EPI-Covid-POP a été réalisée par l’Institut Pasteur de Guyane au domicile des participants en population générale. L’Institut Pasteur de Guyane ne dispose pas, contrairement à un établissement hospitalier, d’un dossier administratif permettant un suivi des participants.
Les efforts à mettre en œuvre pour cette ré-information seraient disproportionnés et entraveraient la bonne réalisation du projet. La population en Guyane est très mobile et les personnes changent de coordonnées téléphoniques très régulièrement rendant impossible la capacité à retrouver une personne. L’Institut Pasteur de Guyane a déjà eu des difficultés à pouvoir réaliser le suivi des participants au cours d’une même étude de type RIPH2 (projet Epi-COVID19, promotion Institut Pasteur) pour laquelle il y avait un suivi sur une durée d’un an.
Ainsi, la note d’information du projet SerOBHAG sera envoyée à l’adresse des participants mais l’Institut Pasteur de Guyane ne peut garantir que ces notes d’information seront reçues. Si certaines reviennent par retour de courrier, l’Institut Pasteur de Guyane n’aura pas les moyens matériels de retrouver les participants. C’est pourquoi une dérogation à l’information individuelle des participants au projet EPI-COVID-POP est donc demandée auprès de la CNIL.
En outre, une information collective sera mise en place sur le site de l’Institut Pasteur de la Guyane, annonçant l’étude et permettant aux participants du projet EPI-COVID-POP ayant initialement donné leur accord à une réutilisation potentielle de s’opposer par e-mail à la réutilisation de leurs échantillons et de leurs données dans le cadre de ce projet SerOBHAG. https://www.pasteur-cayenne.fr/la-recherche/nos-equipes/laboratoire-de-…