SARCGYN : séquençage et caractérisation clinico-pathologique et transcriptomique d’une série de sarcomes du stroma endométrial de l’utérus
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Le paradigme diagnostique des sarcomes du stroma endométrial (SSE) a été modifié dans les 5 dernières années par l’apport du séquençage à haut débit avec la mise en évidence de fusions drivers dans ces sarcomes.
La détection de nouvelles fusions pose le problème d’une part de leur signification biologique et d’autre part de leur valeur diagnostique et pronostique.
Objectifs.
1. Description du panorama transcriptomique et mutationnel dans la plus grande série de SSE
2. Identification de nouvelles fusions et mutations récurrentes dans les SSE
3. Classification par clustering des SSE
4. Etudes des biomarqueurs issus de l’analyse d’expression et recherche de marqueurs immunohistochimiques
5. Intégration des données d’expression avec les données cliniques
6. Constitution de la plus grande série de SSE annotée dans la base REDCap avec données clinico-pathologiques et moléculaires, et lames numérisées disponibles pour ultérieures études.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
Indispensables pour établir les courbes de survie et le différentiel dans l’expression génique
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
5
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Les personnes se prêtant à l'étude ont la possibilité d'accéder, de rectifier, ou de limiter le traitement de leurs données personnelles. Elles ont également le droit de s'opposer au traitement de leurs données personnelles. Le droit à l'effacement s'applique lorsque la personne concernée exerce son droit d'opposition et demande également l'effacement des données la concert déjà collectées. Certaines données préalablement collectées peuvent cependant ne pas être effacées, si cette suppression est susceptible de rendre impossible ou de compromettre gravement la réalisation des objectifs de la recherche. Ces droits peuvent s'exercer auprès du délégué à la protection des données du responsable de traitement à l'adresse suivante : donneespersonnelles@bordeaux.unicancer.fr