Risques de sous-estimation des arboviroses autochtones en Corse

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

L’analyse des résultats permettra de faire l’état de lieux sur les démarches et les difficultés diagnostiques des arboviroses et pourra ouvrir une discussion avec le CNR arboviroses sur l’amélioration des pratiques. On attend à ce que ce travail aide dans l’élaboration d’un parcours pour des patients atteints d’arboviroses.

Objectifs
Objectif principal :
- Décrire la démarche diagnostique des arboviroses en Haute-Corse entre 2019 et 2024, ainsi que les résultats des analyses réalisées au CH Bastia et en ambulatoire : sérologie, PCR arboviroses.
Objectifs secondaires :
- Décrire les cas d’arboviroses autochtones confirmés et suspects d’arboviroses, diagnostiqués au CH Bastia, complétés, par les résultats de séroneutralisation,
- Analyse des cas de méningo-encéphalite sans documentation microbiologique, chez les patients hospitalisés au CH Bastia entre 2019-2024, en termes d’une opportunité manquée de diagnostic d’arbovirose.
- Décrire des difficultés diagnostiques en Haute-Corse.

Méthodes et méthodologie
Il s’agit d’une étude rétrospective non interventionnelle (MR004). Des résultats des examens microbiologiques des arboviroses des cinq dernières années (âge, genre, date exacte de prélèvement et résultats de sérologie et PCR : dengue, chikungunya, zika, Toscana virus, West Nile virus) seront recueillis de la base de données du laboratoire du Centre Hospitalier de Bastia, ainsi que d’un réseau des laboratoires privés en Haute-Corse. L'envoi des données anonymisées sera réalisé par une messagerie sécurisée MSSanté. Les résultats des examens microbiologiques des patients hospitalisés pour méningo-encéphalite au CH Bastia 2019-2024 seront recueillis de la base de données du laboratoire du CH Bastia. La saisie des données sera effectuée dans Access. Le nombre de patients détectés positifs sera présenté sous forme de chiffre brut, le pourcentage des demandes totales et IC95. L’analyse statistique sera réalisée en R.
Demande d’accord de comité éthique ne sera pas nécessaire, car aucune donnée à caractère personnelle des patients ne sera pas analysée.

Population
L’étude porte sur toutes les personnes considérées comme ayant eu une suspicion d’arbovirose passée ou en cours, ayant bénéficié d’une recherche microbiologique d’arbovirose, identifiées en Haute-Corse sur la période du 1er janvier 2019 au 31 juillet 2024.
Les patients seront recrutés au GHT Haute-Corse et aux laboratoires privés, ayant au moins un site en Haute-Corse.
La population des personnes ayant eu un recours au GHT Haute-Corse pour suspicion d’une infection neuroméningée, avec le diagnostic de méningite/encéphalite lymphocytaire de l’origine infectieuse sera également étudiée.