Etude rétrospective pour la théranostique du sarcome par spectrométrie de masse (SpiderMass) en temps réel

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Le groupe national français des sarcomes a montré qu'avant un second avis par des pathologistes experts et des tests moléculaires de confirmation supplémentaires, 30% des tumeurs des tissus mous, appelées aussi sarcomes, sont mal diagnostiquées. Cette difficulté de diagnostic entraîne une prise en charge inappropriée des patients avec un sous-traitement (par exemple une résection incomplète des sarcomes) ou un surtraitement (par exemple l'administration d'une radiothérapie ou d'une chimiothérapie pour les tumeurs bénignes).
Le projet propose d’utiliser la spectrométrie de masse (analyse lipidomique par SpiderMass) pour fournir des signatures moléculaires rapides, précises et fiables pour le diagnostic des sarcomes.
L’étude inclut des patients pris en charge chirurgicalement pour un sarcome au Centre Oscar Lambret ou pour lesquels une expertise d’anatomopathologie a été réalisée par le Centre Oscar Lambret entre 2014 et 2024 inclus; mais aussi des échantillons de l’Institut Bergonié de Bordeaux.
Un total de 1 000 échantillons paraffinés (FFPE) de diagnostic seront colligés pour le projet dans l’objectif de couvrir l’entièreté des entités histologiques des sarcomes existants (22 types et 18 mimics différents).
Une analyse lipidomique sera réalisée par spectrométrie de masse (SpiderMass) pour construire une librairie de spectres annotés par le diagnostic histologique. Une classification informatique sera établie pour identifier précisément le diagnostic du sarcome (sous-type et grade de la lésion). Elle sera validée sur une cohorte externe en aveugle des résultats diagnostics.
Les résultats de spectrométrie de masse seront traités, analysés et corrélés aux données cliniques.