Etude du transcriptome pulmonaire des patients atteints de tuberculose

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

La tuberculose est une maladie infectieuse provoquée par une mycobactérie du complexe tuberculosis. Il s’agit de la 3ème cause de mortalité dans le monde par maladie infectieuse. Depuis 2019 on assiste à une recrudescence du nombre de cas en Ile-de-France, notamment dans le département du Val-de-Marne (94), qui est le 3ème département en Ile-de-France où l’incidence est la plus élevée. Il s’agit donc d’un problème majeur de santé publique... . Le diagnostic de la tuberculose au laboratoire présente certaines difficultés liées aux propriétés intrinsèques de M. tuberculosis. S’agissant d’une bactérie à croissance lente, la durée d’incubation nécessaire des cultures bactériennes est allongée. La réalisation d’analyses de biologie moléculaire est également rendue complexe non seulement par les prélèvements qui sont généralement pauci-bacillères, mais aussi parce que M. tuberculosis présente des parois rigides et difficiles à lyser, ce qui rend l’extraction des acides nucléiques difficile. Ces deux derniers paramètres compliquent la mise au point d’une technique de PCR suffisamment sensible et expliquent également la faible valeur prédictive négative des techniques de PCR commerciales, comme par exemple le MTB Rif/Ultra Genexpert®... . Dans cette étude, nous nous intéressons à la place que pourrait avoir la transcriptomique dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire. A notre connaissance, des études du transcriptome de l’hôte lors d’infections tuberculeuses ont été réalisées uniquement sur des prélèvements sanguins et mettent en évidence l’implication de la voie de l’interféron gamma, qui est peu spécifique. En se plaçant directement au site de l’infection, cela permettrait d’identifier une signature transcriptomique spécifique chez les patients atteints de tuberculose pulmonaire... . Cette étude devrait permettre d’identifier des marqueurs complémentaires au diagnostic de la tuberculose pulmonaire, permettant une prise en charge plus précoce des patients. Aussi, elle devrait permettre de mieux comprendre la réponse immunitaire de l’hôte en cas d’infection tuberculeuse.