Epidémiologie des bactériémies à Mycobacterium tuberculosis dans un pays à ressources élevées (HEMOCTUB)

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Près de 43 millions de vies ont été sauvées entre 2000 et 2014 grâce au diagnostic et au traitement de la tuberculose. Un diagnostic précoce et performant reste donc un point clé pour le contrôle de l’épidémie de tuberculose. Les hémocultures positives à Mycobacterium tuberculosis sont principalement décrites lors des co infections VIH et tuberculose pour des patients vivant en Afrique sub-saharienne. Peu de données existent pour les pays à hautes ressources comme la France avec une incidence moindre de co-infections VIH-Tuberculoses. Le but de cette étude rétrospective est donc d’étudier l’épidémiologie des bactériémies à Mycobacterium tuberculosis en France. Les résultats permettraient de mieux cibler les indications des hémocultures lors d’une suspicion de tuberculose, d’évaluer l’apport des hémocultures pour le diagnostic d’une tuberculose et enfin de prévoir un bilan d’extension approfondi en cas de tuberculose bactériémiante.
L'objectif principal de l'étude est d'identifier les facteurs de risque de bactériémies à Mycobacterium tuberculosis dans un pays à hautes ressources
Les objectifs secondaires de l'étude sont les suivants :
1. Décrire les caractéristiques cliniques, radiologiques et biologiques des patients bactériémiques comparativement aux patients non bactériémiques.
2. Estimer la prévalence des bactériémies à M. tuberculosis parmi les patients tuberculeux adultes avec hémoculture prélevée, sur la période de 2017-2023, en France.
3. Développer et valider un score clinique simplifié prédictif de bactériémie à M. tuberculosis, destiné à guider les indications d’hémocultures en pratique courante.

La population étudiée correspond aux patients adultes avec un diagnostic microbiologique de tuberculose maladie et une hémoculture prélevée pour recherche de mycobactéries.
Les critères d’inclusion sont:
1. Patient âgé de 18 ans ou plus
2. Patients informés et ne s’étant pas opposés à participer à la recherche
3. Patient pris en charge en consultation ou en hospitalisation dans un des services participant à l’étude
4. Diagnostic de tuberculose maladie, défini par la présence de signes cliniques et/ou radiologiques compatibles avec une tuberculose, associé à une confirmation microbiologique entre le 01/01/2017 et le 31/12/2023
5. Réalisation d’au moins une hémoculture spécifique mycobactéries au cours de l’épisode de diagnostic
Les critères de non inclusion sont :
1. Absence de tuberculose maladie
2. Suspicion de tuberculose non confirmée microbiologiquement
3. Infection documentée à mycobactéries non tuberculeuse sans isolement de Mycobacterium tuberculosis
4. Absence de réalisation d’hémoculture au cours de l’épisode diagnostique
5. Patients sous tutelle/curatelle
Méthode d’analyse des données :
Les patients seront répartis en deux groupes selon le statut hémoculture (positive vs négative à M. tuberculosis). Les caractéristiques des deux groupes seront comparées par tests bivariés (test t ou Mann-Whitney, chi-carré ou Fisher) avec calcul des différences standardisées (SMD). Les facteurs de risque indépendants de bactériémie seront identifiés par régression logistique multivariée pénalisée (LASSO). La prévalence des bactériémies sera estimée avec IC95 % de Wilson. Un score de risque clinique simplifié sera développé et ses performances évaluées par AUC-ROC, calibration et Decision Curve Analysis.
Les données manquantes seront gérées par imputation multiple (MICE).
Toutes les analyses seront réalisées sous R (version ≥ 4.3).