Constitution d’une collection d’échantillons biologiques visant à explorer les causes et les bases physiopathologiques des défauts de développement oculaire

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Les malformations oculaires congénitales sont des affections rares et sévères, principalement d’origine génétique. Ces
malformations sont d’apparition précoce puisqu’elles résultent d’un défaut de développement de l’oeil au cours de la grossesse.
Elles sont généralement détectées à la naissance et peuvent s’intégrer dans des formes syndromiques, c’est-à-dire s’associer à
d’autres malformations ainsi qu’à une déficience intellectuelle. Bien que certaines bases génétiques soient identifiées, plus de la
moitié des patients (toutes anomalies confondues) restent sans diagnostic génétique. Le diagnostic génétique est cependant une
donnée cruciale dans la prise en charge du patient et de sa famille (diagnostic, prise en charge, suivi, conseil génétique, diagnostic
prénatal). Il est donc indispensable de progresser dans la connaissance de ces bases génétiques. Le diagnostic génétique de ces
affections repose actuellement sur l’utilisation des technologies de séquençage nouvelle génération (NGS). Ces technologies
permettent la détection d’un très grand nombre de variants (ou mutations) qui sont interprétés au regard des connaissances
actuelles. De nombreux variants restent donc de signification incertaine, ils sont potentiellement bénins (n’entrainent pas de
maladie) mais peuvent potentiellement être responsables de la pathologie oculaire observée chez le patient. Un moyen d’étudier
l’impact de ces variants génétiques est de pouvoir directement disposer de prélèvements du patient afin de procéder à des études
complémentaires permettant d’identifier la cause ou le mécanisme génétique/cellulaire en jeu. De même, lorsqu’aucun variant
candidat n’est détecté par les moyens utilisés, d’autres prélèvements peuvent permettre d’explorer d’autres causes grâce à de
nouvelles technologiques. Ces prélèvements peuvent, dans certains cas, faire l’objet de mise en culture et de transformations
secondaires afin de générer par exemple des modèles cellulaires en deux ou trois dimensions (organoïdes) qui facilitent ensuite
l’étude des mécanismes génétiques et cellulaires sous-jacents en cause dans la pathologie oculaire du patient. L’analyse de ces
prélèvements et l’établissement de ces modèles cellulaires permettent également de pouvoir envisager des études visant d’une
part à approfondir la connaissance physiopathologique de ces maladies congénitales et d’autre part à tester de nouvelles
approches ou molécules à visée thérapeutique avant d’envisager une étude à l’aide d’un modèle animal très souvent utilisé en
recherche faute d’autre modèle disponible. Par ailleurs, la possibilité de disposer de ressources biologiques collectées de façon
systématique et déjà disponibles permet de répondre plus rapidement à certaines questions en fonction des avancées de la
recherche et des technologies.
Ce projet de constitution d’une collection biologique s’inscrit dans le prolongement de l’activité médicale hospitalière de deux
entités coordonnées par le service de génétique médicale du CHU de Toulouse : le Centre national de référence des Affections
Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO) et le laboratoire national de référence (LBMR) dédié au diagnostic moléculaire des
anomalies malformatives de l’oeil. Cette expertise clinico-biologique reconnue sur le plan national et international permet à l’équipe
du service de génétique médicale de participer depuis près de deux décennies aux différentes avancées faites dans le domaine de
la recherche des malformations oculaires et de la prise en charge des patients.