Caractérisation génomique, épidémiologique et clinique de Toxoplasma gondii à La Réunion (TOXRUN)
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
La toxoplasmose est une infection parasitaire majeure, particulièrement préoccupante chez la femme enceinte et les personnes immunodéprimées. Chez la femme enceinte, elle peut entraîner une transmission au fœtus avec des conséquences allant d’atteintes oculaires à la mort fœtale selon le stade de la grossesse. Chez les immunodéprimés (transplantés, greffés de CSH, patients vivant avec le VIH), elle peut provoquer des infections graves, voire mortelles. Certaines souches atypiques, plus virulentes, sont responsables de formes sévères, y compris chez des sujets immunocompétents. En raison de sa situation géographique et de ses conditions environnementales (climat tropical, forte population de chats errants, pratiques alimentaires, exposition aux sols), La Réunion pourrait favoriser la circulation de génotypes variés de Toxoplasma gondii. Cette étude a pour objectif de caractériser la diversité génétique des souches circulant à La Réunion afin d’améliorer les connaissances épidémiologiques locales, d’adapter les stratégies de prévention et de prise en charge, et de renforcer la surveillance microbiologique et les actions de santé publique.
Il s'agit d'une étude observationnelle analytique rétrospective multicentrique portant sur l’ensemble des patients ayant présenté une toxoplasmose documentée entre le 1er janvier 2021 et le 31 décembre 2025 au CHU de La Réunion (site Nord et site Sud), au GHER ou au CHOR et dont au moins un prélèvement biologique positif en PCR pour T. gondii est conservé en biothèque. La PCR a été réalisée au moment du diagnostic ou rétrospectivement pendant l’étude.
Objectif principal :
Décrire les génotypes des souches cliniques de Toxoplasma gondii (T. gondii) identifiées dans les différents centres hospitaliers de La Réunion entre 2021 et 2025, et réaliser une analyse phylogénétique exploratoire afin de positionner ces souches par rapport aux génotypes connus.
Objectifs secondaires :
1) Comparer les résultats du génotypage obtenus à l’aide de la technique mise au point au cours de l’étude avec les résultats du génotypage obtenus par le Centre National de Référence (CNR) de la toxoplasmose grâce à la technique de référence basée sur les marqueurs microsatellites
2) Caractériser les génotypes de T. gondii identifiés à La Réunion en fonction du phénotype clinique, des caractéristiques épidémiologiques et de la répartition annuelle par service clinique des patients de l’étude
3) Déterminer la proportion de souches autochtones et décrire la répartition spatio-temporelle des différents génotypes identifiés à La Réunion
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)
Déplacements
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
Date et nature du prélèvement pour répondre à l'objectif secondaire de répartition spatio-temporelle des différents génotypes identifiés.
Date et service d'hospitalisation pour répondre à l'objectif secondaire de de description des différentes manifestations cliniques de la toxoplasmose ainsi que les caractéristiques épidémiologiques en fonction des services d’hospitalisations.
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
15
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
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