Caractérisation des souches impliquées dans les infections invasives à Bacillus cereus du nouveau-né prématuré par Whole Genome Sequencing
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Le groupe Bacillus cereus est un complexe d’espèces bactériennes phylogénétiquement proches connues pour être responsables de toxi-infections alimentaires mais qui sont aussi responsables de sepsis et de choc septique chez des nouveaux nés prématurés, avec un taux de mortalité pouvant atteindre 30%.
Les objectifs de l’étude sont de caractériser en utilisant le Whole Genome Sequencing les souches de Bacillus cereus responsables d’infections chez les nouveaux nés prématurés et de corréler la gravité clinique des infections au contenu en gènes de virulence.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
Les infections invasives du NNP dues au complexe Bacillus cereus sont des infections rares mais graves potentiellement responsables de sepsis sévères et de choc septique, avec un taux de mortalité pouvant atteindre 30%. En ce sens il s’agit d’un problème de santé publique.
La meilleure identification des espèces du complexe B. cereus impliquées dans les infections graves ainsi, qu’une meilleure connaissance de leur contenu en gènes de virulence pourrait permettre de mettre en œuvre de nouveaux moyens diagnostiques et thérapeutiques de prise en charge des NNP infectés. Ainsi notre étude pourrait avoir un réel impact en santé publique.
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement
Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
15
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Information individuelle des usagers, et des enfants et de leurs représentant légaux.
Droit d’accès et droit à la portabilité :
Le patient peut exercer son droit d’accès aux informations qui le concerne en écrivant au DPO du CHU de NICE : dpo@chu-nice.fr ou à l’adresse postale suivante : Hôpital Archet 2, DINSI, Command center à l’attention du DPO, 151 rte St Antoine de Ginestière, 06200 Nice.
Le droit à la portabilité ne concerne pas les recherches dont la licéité est l’intérêt public ou l’intérêt légitime.
Droit de rectification et droit à l'effacement (droit à l'oubli) :
Le patient peut exercer son droit de rectification aux informations qui le concerne en écrivant au DPO du CHU de NICE : dpo@chu-nice.fr ou à l’adresse postale suivante : Hôpital Archet 2, DINSI, Command center à l’attention du DPO, 151 rte St Antoine de Ginestière, 06200 Nice.
Le droit à l’effacement : Si la personne fait une demande particulière d’effacement des données, le responsable de traitement peut ne pas faire droit à cette demande sous réserve d’une information préalable des personnes car ce droit est susceptible de rendre impossible ou de compromettre gravement la réalisation des objectifs de la recherche (Articles 17.3.c et 17.3.d. du RGPD). La personne est informée du fait que les données recueillies préalablement au retrait du consentement pourront ne pas être effacées et pourront continuer à être traitées dans les conditions prévues par la recherche.
Droit de limitation et droit d'opposition :
Le patient peut exercer son droit de limitation et droit d’opposition aux informations qui le concerne en écrivant au DPO du CHU de NICE : dpo@chu-nice.fr ou à l’adresse postale suivante : Hôpital Archet 2, DINSI, Command center à l’attention du DPO, 151 rte St Antoine de Ginestière, 06200 Nice.