Spectre clinique des variants pathogènes et probablement pathogènes de RNU4 et RNU5/ French_RNUs
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Une étude anglo-saxone vient d’être mise en ligne sur MedRXIV et est actuellement en révision mineure dans Nature : https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.04.07.24305438v1.full.pdf.
Cette étude rapporte une série de 119 individus portant une variation génétique hot-spot dans un ARN non codant (RNU4-2) impliqué dans le processus fondamental et ubiquitaire de l’épissage des introns pour la maturation des transcrits.
Les variations identifiées sont responsables d’une maladie rare tout juste découverte et seules les données de 33 individus sont détaillées dans cet article.
Grâce aux données génomiques produites dans le soin via le Plan France Médecine Génomique 2025 par AURAGEN et SeqOIA, ou dans la recherche, nous avons pu identifier presque 150 individus atteints de cette nouvelle maladie sur le territoire national.
Le réseau de centres de référence français permet d’envisager une publication assez riche sur le plan des données cliniques collectées.
French_RNUs vise à identifier les individus porteurs de variants pathogènes ou probablement pathogènes des RNU4 et 5, collecter des données existantes issues du soin et en faire la synthèse dans un article publié, avec l’objectif d’être la deuxième série de cas, et la plus large série documentée sur le plan clinique.
L’objectif principal de ce projet est de décrire sur le plan clinique, l’ensemble des patients porteurs d’un variant candidat de RNU4-2, identifiés grâce aux données génomiques produites dans le soin par les centres partenaires ou dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025 par AURAGEN et SeqOIA.
L’objectif secondaire est de décrire les mêmes éléments concernant des variations candidates des gènes du spliceosome RNU5 pour déterminer si une pathologie génétique est causée par ce gène.
- Historique des données (dates d’enregistrement des données de santé dans le dossier médical ou autres supports) : 01/2000 au 12/2024
Critères d’inclusion :
- individu mineur ou majeur porteur d’un variant candidat de RNU4 ou RNU5 ou autre gène du spliceosome majeur ne codant pas pour une protéine
- identifié grâce aux données génomiques produites dans le soin ou de la recherche et mentionnées sur un compte rendu d’analyse
- suivi dans un des centres de référence participant à ce réseau
Critères de non-inclusion : Patient(es) s’opposant à l’utilisation de leurs données dans le cadre de la recherche ou représentant légaux pour les patients mineurs.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement
Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
2
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Ré-Information