Performances diagnostiques de la PCR Pneumocystis jiroveci sur gargarisme oropharyngé pour le diagnostic de pneumocystose
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Le diagnostic de pneumocystose (pneumonie potentiellement fatale) repose le plus souvent sur la recherche de matériel génétique (PCR) du champignon, Pneumocystis jiroveci, sur des prélèvements respiratoires profonds réalisés lors d’une fibroscopie bronchique.
Or, cet examen est invasif et peut aggraver la situation clinique et notamment respiratoire du patient.
L’hypothèse posée est que la recherche de matériel génétique de Pneumocystis jiroveci par PCR sur gargarisme oropharyngé soit suffisante pour faire le diagnostic de pneumocystose permettant ainsi de s’affranchir de la réalisation d’une fibroscopie bronchique.
Dans l’étude seront inclus des patients adulte pris en charge au CHU de Bordeaux et à l’hôpital Foch pour pneumonie et ayant eu une recherche de de matériel génétique de Pneumocystis jiroveci sur gargarisme oropharyngé et sur un autre prélèvement respiratoire.
Les performances diagnostiques de la PCR Pneumocystis jiroveci sur gargarisme oropharyné seront estimées en comparant le nombre de cas de pneumocystose réellement diagnostiquées sur prélèvements respiratoires profonds au nombre de pneumocystose diagnostiquées en utilisant le gargarisme oropharyngé.
Une estimation de la capacité de la PCR sur gargarisme oropharyngée à distinguer les patients réellement atteints de pneumocystose versus ceux qui ne le sont pas pourra être ainsi réalisée.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
2
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Chaque participant a reçu une note d’information spécifique à la recherche lui présentant ses droits des articles 15 à 20 du RGPD.
Le participant a été informé que l’exercice de ses droits peut s’effectuer par écrit auprès du professionnel de santé ayant inclus le participant qui transmettra la demande au Responsable(s) de traitement(s). Le(s) Responsable(s) de traitement, en concertation avec le délégué à la protection des données du CHU de Bordeaux, répondra aux demandes du participant conformément à ses obligations légales et réglementaires.