Evaluation des tests biopsie liquide de la société Pillar Biosciences Inc sur plateforme NGS
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
L’objectif de cette étude est d’évaluer les performances et le workflow du panel biopsie liquide oncoRevealTM Core et du panel biopsie liquide oncoRevealTM Fusion de Pillar Bioscience, Inc. dans un modèle de test décentralisé. Le panel de biopsie liquide oncoRevealTM Core est un test NGS robuste qui interroge 104 gènes (Core Panel) d’intérêt dans plusieurs types de cancer à tumeurs solides. Le panel de biopsie liquide de fusion oncoRevealTM est un kit de préparation de banque NGS couvrant des points de rupture spécifiques des transcrits de fusion de 18 gènes pilotes avec 83 partenaires. Les panels sont spécialement conçus pour l’ADN tumoral libre circulant (cfDNA). Les tests utilisent la technologie d’amplification proprietaire (SLIMamp®) exclusive à Pillar Biosciences, une chimie de préparation de banque basée sur des amplicons en mosaïque pour un enrichissement efficace de la cible à tube unique.
Dans cette étude observationnelle, l’équipe de Pillar Bioscience formera chaque site à l’utilisation du panel de biopsie liquide oncoRevealTM Core et du panel de biopsie liquide oncoRevealTM Fusion pour tester un minimum de 50 échantillons de NSCLC collectés prospectivement qui ont déjà prealablement testés. Les résultats du séquençage seront analysés à l’aide de l’outil logiciel d’analyse secondaire PiVAT de Pillar, installe sur site, et comparés aux résultats précédents. L’équipe de Pillar Bioscience fournira des instructions d’installation pour la mise en place de PiVAT sur site. L’étude sera réalisée dans plusieurs sites et les données seront agrégées et publiées.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)
Générer des données comparatives sur un minimum de tissus/échantillons Biopsies liquides correspondants (échantillons excédentaires de patients ou tests comparatifs) pour des tests en parallèle de biopsie liquide et tissulaire dans un cadre réel avec du tissu tumoral FFPE et du plasma obtenus à partir de patients atteints de NSCLC métastatique à l’aide du test oncoRevealTM Core LBx et du test oncoRevealTM Fusion LBx fonctionnant sur le système NGS Illumina NextSeq.
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement
Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
2
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Les pathologistes identifieront les patients à sélectionner pour l’évaluation. Celle ci est uniquement observationnelle pour comprendre les performances d’un nouveau test de biopsie liquide NGS par rapport aux tests NGS actuellement validés.
Aucune donnée identifiable ne sera partagée en dehors du CHU de Nice. Côte d’Azur