N° 19689872

Evaluation des tests biopsie liquide de la société Pillar Biosciences Inc sur plateforme NGS

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Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Recherche, étude, évaluation

Objectifs poursuivis

Diagnostics

Domaines médicaux investigués

Cancérologie

Bénéfices attendus

L’objectif de cette étude est d’évaluer les performances et le workflow du panel biopsie liquide oncoRevealTM Core et du panel biopsie liquide oncoRevealTM Fusion de Pillar Bioscience, Inc. dans un modèle de test décentralisé. Le panel de biopsie liquide oncoRevealTM Core est un test NGS robuste qui interroge 104 gènes (Core Panel) d’intérêt dans plusieurs types de cancer à tumeurs solides. Le panel de biopsie liquide de fusion oncoRevealTM est un kit de préparation de banque NGS couvrant des points de rupture spécifiques des transcrits de fusion de 18 gènes pilotes avec 83 partenaires. Les panels sont spécialement conçus pour l’ADN tumoral libre circulant (cfDNA). Les tests utilisent la technologie d’amplification proprietaire (SLIMamp®) exclusive à Pillar Biosciences, une chimie de préparation de banque basée sur des amplicons en mosaïque pour un enrichissement efficace de la cible à tube unique.

Dans cette étude observationnelle, l’équipe de Pillar Bioscience formera chaque site à l’utilisation du panel de biopsie liquide oncoRevealTM Core et du panel de biopsie liquide oncoRevealTM Fusion pour tester un minimum de 50 échantillons de NSCLC collectés prospectivement qui ont déjà prealablement testés. Les résultats du séquençage seront analysés à l’aide de l’outil logiciel d’analyse secondaire PiVAT de Pillar, installe sur site, et comparés aux résultats précédents. L’équipe de Pillar Bioscience fournira des instructions d’installation pour la mise en place de PiVAT sur site. L’étude sera réalisée dans plusieurs sites et les données seront agrégées et publiées.

Données utilisées

Catégories de données utilisées

Autre

Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)

Générer des données comparatives sur un minimum de tissus/échantillons Biopsies liquides correspondants (échantillons excédentaires de patients ou tests comparatifs) pour des tests en parallèle de biopsie liquide et tissulaire dans un cadre réel avec du tissu tumoral FFPE et du plasma obtenus à partir de patients atteints de NSCLC métastatique à l’aide du test oncoRevealTM Core LBx et du test oncoRevealTM Fusion LBx fonctionnant sur le système NGS Illumina NextSeq.

Source de données utilisées

Autre

Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)

Données issues de dispositifs médicaux

Appariement entre les sources de données mobilisées

  Non

Plateforme utilisée pour l'analyse des données

Autre

Acteurs finançant et participant à l'étude

Responsable(s) de traitement

Type de responsable de traitement 1

Acteur du dispositif médical

Responsable de traitement 1

Jean Claude GERARD

Pillar Biosciences Inc. 9 Strathmore Road MA 01760 Natick États-Unis

Localisation du responsable de traitement 1
  Hors UE
Représentant du responsable de traitement 1
Jean Claude GERARD

Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement

Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1

Centre hospitalier Universitaire de Nice

4 Avenue Reine Victoria 06000 Nice 06000 Nice France

Calendrier du projet

Date de début : 30/09/2024 – Date de fin : 30/11/2024 Durée de l'étude : 2

Base légale pour accéder aux données

Encadrement réglementaire

Méthodologie de référence 005

Destinataire(s) des données

Destinataire des données 1

Pr Paul Hofman

CHU NIce. Hopital Pasteur. 30 voie romaine. 30 Voie Romaine 06000 Nice 06001 Nice France

Destinataire des données 2

Jean Claude GERARD

Pillar Biosciences 01760 Natick États-Unis

Durée de conservation aux fins du projet (en années)

2

Existence d'une prise de décision automatisée

  Non

Fondement juridique

Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)

(1)(e) exécution d’une mission d’intérêt public

Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)

(2)(i) intérêt public dans le domaine de la santé publique

Transfert de données personnelles vers un pays hors UE

  Non

Droits des personnes

Les pathologistes identifieront les patients à sélectionner pour l’évaluation. Celle ci est uniquement observationnelle pour comprendre les performances d’un nouveau test de biopsie liquide NGS par rapport aux tests NGS actuellement validés.

Aucune donnée identifiable ne sera partagée en dehors du CHU de Nice. Côte d’Azur

Délégué à la protection des données

CHU de Nice

Archet 2. RDC. Command Center. 151, route de Ginestriere. 06202 Nice France

dpo@chu-nice.fr