Étude métabolomique du LCR pour le diagnostic différentiel des encéphalites virales - METAVIR

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

L’encéphalite est une pathologie cérébrale grave définie comme la présence d’un processus inflammatoire cérébral aigue ou subaiguë se manifestant cliniquement par une symptomatologie neurologique(Tunkel et al. 2008). L’incidence des encéphalites est estimée à 5/100,000 habitants (Granerod et al. 2013). Les encéphalites sont d’origine infectieuse, auto-immune, ou paranéoplasique. La cause la plus fréquente d’encéphalite en France est l’encéphalite à Herpes simplex Virus (HSV) avec 27% des étiologies infectieuses en France ces dernières années (Mailles et al. 2022), puis le Virus varicella zooster (VZV, avec 13%. Les herpesvirus (HSV et VZV) sont une famille de virus enveloppés à ADN double brin caractérisée notamment par un neurotropisme, pouvant être associés chez l’homme à des infections du système nerveux central (SNC), méningites et encéphalites. Les méningites se distinguent des encéphalites par l’absence de symptomatologie neurologique centrale.
Souvent, la distinction clinique entre encéphalite et méningite sans souffrance cérébrale peut être complexe, notamment en cas de facteurs confondants pouvant également être responsable d’une confusion aigue : mauvaise tolérance de la fièvre, hyponatrémie, rétention aigue d’urine, confusion sur l’infection chez la personne âgée. Les résultats de la ponction lombaire ne permettent pas non plus de distinguer une méningite et une encéphalite. Seule l’IRM permet de mettre en évidence la souffrance du parenchyme cérébral, mais celle-ci est rarement accessible en urgence dans les premières heures de prise en charge, et n’est pas modifiée chez tous les patients avec une encéphalite (Venkatesan et al. 2019).
Le traitement de référence des encéphalites à HSV et à VZV est l’aciclovir par voie intraveineuse. Le traitement par aciclovir a considérablement amélioré le pronostic des encéphalites à herpes virus, avec une mortalité globale passant de 50-54% à 19-28% en comparaison à la vidarabine, l’ancien traitement de référence (Skoldenberg and Forsgren 1985; Whitley 1990). Cependant, ce traitement doit être prescrit à forte posologie pour s’assurer de sa bonne diffusion au niveau du système nerveux central. Il a pour effet secondaire majeur une néphrotoxicité, ayant pour mécanisme une précipitation de cristaux au niveau tubulaire (Perazella 1999). L’incidence de la survenue d’une insuffisance rénale aigue sous traitement par aciclovir est estimée dans des études récentes entre 13 et 17,8% (Ryan et al. 2018; Lee et al. 2018) .
La sanction thérapeutique peut donc être lourde chez les patients qui se présentent initialement pour une méningite à HSV ou à VZV, associée à une symptomatologie neurologique d’étiologie non cérébrale.
Notre objectif dans ce projet est d’évaluer s’il est possible de discriminer l’encéphalite de la méningite sans signes neurologiques centraux à l’aide de la métabolomique non ciblée du LCR, dans le but de permettre un diagnostic différentiel et donc d’améliorer la prise en charge thérapeutique des patients. La métabolomique est en effet une méthode puissante pour mettre en évidence les atteintes cellulaires, au travers des produits du métabolisme, en lien direct avec la physiopathologie. De plus, le LCR est le plus proche reflet du fonctionnement cérébral.