Caractérisation des tumeurs primitives du rein après un traitement systémique - NEPOSTIO

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Les nouvelles immunothérapies par ICI (inhibiteurs des points de contrôles immunitaires) ont révolutionné la prise en charge des patients en première ligne de cancer du rein métastatique. Parallèlement, la néphrectomie cytoréductive première n’est plus recommandée chez les patients à risque intermédiaire et élevé depuis les données de l’étude CARMENA. En revanche, en cas de réponse complète sur les sites métastatiques après traitement par ICI, il semblerait qu’une néphrectomie « de clôture » soit faisable avec des résultats carcinologiques intéressants (Pignot et al. Eur Urol 2020).
Les premières données anatomopathologiques semblent trouver des remaniements inflammatoires et des infiltrats de cellules immunitaires sur les
pièces de néphrectomie, notamment en cas d’exposition prolongée au traitement.
L’objectif de ce projet est de pouvoir analyser les caractéristiques anatomopathologiques des pièces de néphrectomies post-immunothérapie et
de caractériser les altérations moléculaires et immunes de ces tumeurs à partir des patients identifiés dans la base UroCCR.
Afin de mieux comprendre si les altérations immunes et moléculaires identifiées sont spécifiques à ce sous-groupe, nous identifierons dans la base UroCCR, des patients opérés d’une néphrectomie après traitement systémique par antiangiogénique seul (cohorte contrôle).
Ainsi, une comparaison des profils moléculaires et immuns sera réalisée dans les 2 cohortes. Un transcriptome entier sera réalisé sur le matériel disponible et une déconvolution des cellules immunes sera réalisée en utilisant les techniques habituelles (MCP-Counter, CIBERSORT). Ces analyses moléculaires seront complétées par des études immuno-histochimiques (IHC) pour mieux typer les cellules immunes en fonction des données de RNAseq et de séquençage à l’échelle de cellules uniques. Parallèlement, une caractérisation génétique de
ces tumeurs sera faite par séquençage des exomes et/ou génome entiers à la recherche de mutations spécifiques enrichies dans ce groupe versus les données de la littérature et le groupe de patients traités par inhibiteurs de tyrosine kinase (TKI) seuls (Classe et al. Cell Reports, 2018). Enfin, une caractérisation épigénétiques de ces tumeurs sera réalisée.

Objectif principal
Compréhension des maladies

Objectifs secondaires
-Comparer les caractéristiques immuno-histochimiques et moléculaires des néphrectomies différées chez les patients traités par immunothérapie
versus un inhibiteur de tyrosine kinase (TKI) seul.
- Identifier des marqueurs génétiques et épigénétiques prédictifs de la réponse aux inhibiteurs des points de contrôles immunitaires (ICI)
- Identifier des facteurs pronostiques associés à la survie des patients
- Identifier les caractéristiques du microenvironnement des tumeurs non à cellules claires du rein versus celle à cellules claires

Critère d’évaluation principal
Caractéristiques immuno-histochimiques et moléculaires des tumeurs rénales des patients traités par ICI

Critères d’évaluation secondaires
- Comparaison des caractéristiques immuno-histochimiques et moléculaires des tumeurs rénales des patients traités par ICI versus celles des patients
traités par TKI seul
- Comparaison des caractéristiques immuno-histochimiques et moléculaires des tumeurs rénales des patients non à cellules claires versus celles des
patients ayant des cancers à cellules claires
- Survie sans récidive : du début du traitement ICI à la récidive
- Survie globale : à partir du diagnostic jusqu’au décès, quelle que soit la cause

Critères d’éligibilité
Partie clinique :
Cohorte cas :
1. Patients pris en charge pour un cancer du rein métastatique tel que soit le type histologique
2. Patients traités par inhibiteurs des points de contrôles immunitaires ICI (quel que soit la ligne de traitement)
3. Patients considérés en réponse complète (ou très bonne réponse partielle) sur les sites métastatiques
4. Patients ayant été opérés d’une néphrectomie de manière différée, après traitement par ICI seul ou ICI-TKI
Cohorte témoin :
1. Patients opérés d’une néphrectomie différée en situation de réponse après traitement systémique par anti-angiogéniques seuls pour une maladie
métastatique
Partie moléculaire :
Pour les deux cohortes :
Patients dont du matériel tumoral est stocké dans un centre de ressources biologiques avec consentement adéquat associé (banque de
ressources biologiques virtuelle pour le projet UroCCR)

Critères de non-éligibilité
1. Patients ayant reçu un traitement par ICI dans le cadre d’un protocole néoadjuvant
2. Patients opérés d’une néphrectomie pour des raisons symptomatiques ou autres, sans réponse objectivée au niveau des sites métastatiques
3. Opposition du patient