Plus de 40 contributions dans la Bibliothèque ouverte d’algorithmes en santé !
De nouvelles ressources viennent enrichir la Bibliothèque ouverte d’algorithmes en santé (BOAS), portée par le Health Data Hub. Cette bibliothèque permet de recenser des outils essentiels à la communauté médicale et scientifique, tout en renforçant la collaboration entre développeurs, chercheurs et professionnels de santé.
Ces nouvelles ressources couvrent un large éventail de besoins : identification de pathologies dans le SNDS, extraction de premiers indicateurs, traitement de données complexes ou encore analyse de l’exposition environnementale. Elles viennent compléter l’offre déjà disponible dans la BOAS et facilitent l’usage des données de santé pour différents profils d’utilisateurs.
Identifier des pathologies ou des populations spécifiques dans la base principale du SNDS
Des algorithmes permettent de repérer, sur la base d’informations médico-administratives dans la base principale du SNDS, des situations ou des populations présentant une pathologie ou un trait de santé particulier. Un nouvel algorithme a été mis à disposition :
- Typage du diabète : distinction des patients adultes atteints de diabète de type 1 ou de diabète de type 2 (IQVIA).
Explorer des thématiques spécifiques via des requêtes simples
Les données de santé - et plus particulièrement les données de la base principale du SNDS - sont complexes. Pour faciliter l’accès à des premiers indicateurs sur des populations spécifiques, plusieurs outils de requêtage simple permettent d’obtenir des informations de base sans manipulations complexes des données. Trois nouvelles ressources ont été mises à disposition :
- Vaccination contre la coqueluche des femmes enceintes : repérage des femmes enceintes, reconstitution de la période de grossesse et vérification du statut vaccinal, avec un niveau de détail par mois d’accouchement et par territoire (DNUM).
- Indicateurs sur les populations en affection longue durée (ALD) : calcul d’indicateurs démographiques, du nombre d’indemnités journalières (IJ) sur 4 ans (HDH).
- Délivrance psychotropes hypnotiques : estimation annuelle, à l’échelle de la commune, du nombre de patients susceptibles de présenter des « troubles du sommeil chroniques » à partir des délivrances de psychotropes hypnotiques (Institut Paris Région).
Exploiter les données d’anatomopathologie de manière fiable
La BOAS héberge également des outils techniques permettant d’optimiser le traitement des lames d’anatomopathologie numérisées. Un nouvel outil a été mis en ligne :
- PICOLA : conversion de lames d’anatomopathologie numérisées vers un format réutilisable (TIFF pyramidal), grâce à une chaîne de traitement automatisée (HDH).
Améliorer la précision géographique pour les études d’exposition
Le sommeil est un véritable sujet de santé publique. Sa qualité dépend notamment de l’environnement physique de chacun (ambiances lumineuses, sonores, et thermiques). Le projet SOMNIBRUIT vise à mieux connaître et à quantifier les effets du bruit environnemental sur la santé. Deux ressources issues de cette étude sont déjà ouvertes :
- Génération terrasse : amélioration de la précision géographique des bénéficiaires souffrant de troubles du sommeil dans le SNDS, en lien avec les niveaux de pollution sonore (Bruitparif).
- Exposition sonore : traitement géospatial et statistique permettant d’estimer la population exposée à différents niveaux de bruit environnemental sur le territoire (Bruitparif).
Structurer et harmoniser les données : un effort soutenu au niveau européen
Pour favoriser l’interopérabilité et la réutilisation de ressources en santé, la BOAS héberge également :
- Le catalogue de métadonnées : un outil permettant de déployer son propre catalogue de métadonnées afin de structurer, valider et publier des métadonnées conformes au modèle européen Health DCAT-AP (HDH). Cet outil permet d’automatiser la vérification de cohérence et l’enrichissement des jeux de données afin d’assurer leur interopérabilité entre institutions de santé. Ce socle commun facilite l’alignement des pratiques françaises avec les standards européens en matière d’ouverture et de documentation des données de santé.
La bibliothèque continue de s’enrichir régulièrement. Si vous souhaitez y contribuer ou proposer une ressource, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse suivante : opensource@health-data-hub.fr