Etude CombO : Evaluation des nouvelles combinaisons de molécules en immuno-oncologie à partir des données de vie réelle.

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

L'intérêt pour la santé publique est justifiée par les raisons suivantes :
- Meilleure adaptation des traitements en les combit de manière optimale pour aider la communauté médical et l’industrie pharmaceutique à stratifier les patients pour telle ou telle combinaison de traitement ; elle aura ainsi une répercussion positive pour les futurs patients dont le cancer est difficile à traiter, réfractaires aux traitements classiques ; la stratégie pourra impacter la qualité et la durée de vie des patients ; à terme, l’impact sur la communauté scientifique et la société pourrait être très significatif si l’approche est appliquée chez des patients en situation potentiellement curable, en diminuant les risques de rechute ou de deuxième cancer primitif et donc en réduisant les coûts associés à leur traitement. 

- COMBO n’a pas pour finalité la promotion des produits mentionnés au II de l’article L. 5311-1 en direction des professionnels de santé ou d’établissements de santé. 

- COMBO n’a pas pour finalité l’exclusion de garanties des contrats d’assurance et la modification de cotisations ou de primes d’assurance d’un individu ou d’un groupe d’individus présentant un même risque. 

- L’ensemble des partenaires feront les efforts nécessaires et s’engagent à rapporter la méthode et les résultats de manière transparente, dans des congrès internationaux (ASCO, AACR) et les publier dans un journal à comité de lecture et haut facteur d’impact publication des résultats ; 

- L’ensemble des dispositions seront prises afin de garantir l’intégrité scientifique et la qualité des analyses, en limitant le risque de produire des résultats biaisés. En particulier, des éléments de méthodes ou codes (par ex. algorithmes) permettant de discuter et vérifier la validité des résultats seront rendus publiques.  

- Sanofi met en place une organisation interne et un comité de validation réglementaire afin de garantir la non-poursuite de finalité interdite. La personne déléguée par Sanofi pour la conduite du projet ne pourra réaliser d'extraction, sera soumis aux règles d'accréditation de la plateforme, et aura signé un engagement de conformité individuel. 

- Sanofi aura réalisé un audit de conformité avec le "référentiel d'accès direct au SNDS" avant la mise à disposition des données du SNDS, afin d’assurer que les mesures organisationnelles pour garantir la non-poursuite de finalité interdite sont établies et fonctionnelles

Les objectifs, méthodes et population d'étude sont les suivants :

Méthode :
Les données de la base principale du SNDS chaînées aux données Profiler serviront à identifier les combinaisons médicamenteuses les plus pertinentes par sous-groupes de patients à partir de différentes bases de données génomiques, transcriptomiques, protéomiques, et cliniques. Les données seront complétées par les résultats de l’état de l’art (sous forme de graphe de connaissances) incluant un ensemble de variables sélectionnées manuellement à partir des connaissances issues des essais cliniques (clinicaltrials.gov entre autres) et des connaissances moléculaires et génétiques des réponses aux traitements (relations avec des mécanismes d’activation/d’inactivation de voies de signalisation par exemple). Nous utiliserons ensuite une modélisation multimodale bayésienne et des modèles qui seront enrichis par l’opinion et les connaissances des experts. Nous allons ensuite restreindre et identifier les combinaisons de cancers appartet à des voies d’intérêt. Enfin, le bayésien et la prédiction permettront de concevoir des essais cliniques sur mesure pour des combinaisons sélectionnées, guidés par de nouvelles connaissances sur les molécules, y compris des données précliniques et des modèles mécanistiques (connaissance de la famille, de la classe et du parcours)

Objectifs :
Identifier les combinaisons de thérapies anti-cancéreuses les plus efficaces en utilisant des algorithmes de prédiction entraînées sur des données multimodales, incluant des données de vie réelle, des données génétiques, des données de littérature, des rapports d’essais cliniques et des rapports d’expertise. 

Population d'étude :
Pour ce projet, le CLB fournit les données cliniques et génomiques somatiques (dans la tumeur) recueillies auprès de 3262 patients inclus dans l'étude prospective clinico-biologique PROFILER (NCT01774409) entrant dans la catégorie 1 des "Recherches interventionnelles impliquant la personne humaine autres que les produits de santé" (art. L1121-1 et L5311-1 du Code de Santé Publique). Ces patients ont été inclus entre le 01/04/2013 et le 31/10/2020 et leurs données ont été collectées de leur inclusion jusqu’au 31/10/2020 pour les patients DB1 et jusqu‘au 30/06/2024 pour les patients DB2 (via ConSoRe). PROFILER est un programme de criblage moléculaire destiné aux patients atteints d'un cancer avancé/métastatique ayant déjà reçu une à trois lignes de traitement standard. Pour chaque patient inscrit, un échantillon tumoral (fixé et inclus en paraffine, pouvant être un prélèvement d’archive ou récemment prélevé, provet de la tumeur primitive ou d'une lésion métastatique) fut analysé par séquençage de nouvelle génération