EPISOMA/ Apport d’une approche génétique et épigénétique somatique pour les épilepsies focales pharmacorésistantes : Optimisation du diagnostic pour les dysplasies corticales focales de type 2 (FCD2)

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Le transfert vers le soin de méthodes innovantes de génétique moléculaire impose l’évaluation de leur apport diagnostique par rapport à l’état de l’art (SHD-PAGEM) avant d’en évaluer l’intérêt pronostique. Pour autant, cette approche permettra d’ores et déjà: (i) une confirmation moléculaire génétique somatique de FCD2 pour le conseil génétique ; (ii) une meilleure compréhension de l’épileptogénèse des FCD2 ouvrant la voie au développement de nouvelles options thérapeutiques ciblées; (iii) l’identification de nouveaux biomarqueurs d’intérêt pronostique potentiel de la réponse à la chirurgie. EPISOMA se présente comme une étude pilote dont les résultats pourraient permettre l'ouverture d'une pré-indication de séquençage de génome dédiée aux anomalies en mosaïque, en complément de la pré-indication déjà disponible pour les épilepsies pharmaco-résistantes à début précoce dans le cadre du plan France Médecine Génomique 2025.
Objectif Principal : Evaluation du gain diagnostique des FCD2 par la recherche d’anomalies somatiques par exploration moléculaire des pièces opératoires, par rapport à la recherche de variations constitutionnelles sur ADN leucocytaire.
Objectifs secondaires :1. Evaluation du gain diagnostique respectif du SHD-EPISOMA et du méthylome pour la caractérisation génétique des FCD2, par rapport aux résultats obtenus avec le SHD-PAGEM/2. Évaluation du pourcentage de diagnostics posés par techniques de génétique moléculaire (SHD-EPISOMA/méthylome) selon l'existence avérée (IRM>0) ou suspectée (IRM<0, PET>0) d’une FCD2 en neuroimagerie/3. Évaluation du gain diagnostique des techniques de génétique moléculaire sur les pièces opératoires à histologie négative, par rapport aux données fournies par les études histologiques complétées par des marquages spécifiques/4. Évaluation de la faisabilité et du succès de l’utilisation des techniques de génétique moléculaire à partir de l’ADN extrait des électrodes de SEEG/ 5. Association entre diagnostic génétique (mutation somatique ou variant constitutionnel) et devenir post-opératoire à 1 an.
(a) Critères d’inclusion :
Patients âgés de 2 à 60 ans;
- Souffrant d’une épilepsie focale pharmaco-résistante;
- Avec une FCD2 avérée (IRM>0) ou suspectée (IRM<0, PET>0) en neuro-imagerie ;
- Hospitalisés pour prise en charge chirurgicale de l’épilepsie avec ou sans SEEG préalable ;
- Non opposition du patient ou des représentants légaux à la réutilisation de données et échantillons dans le cadre de la recherche.
Critères de non inclusion :
- IRM<0 et PET<0, ou IRM suggestive d’une lésion autre qu’une FCD2;
- Difficulté à lire ou comprendre le français, ou incapacité à comprendre l’information.