Achromobacter, un pathogène émergent et multirésistant au CHU de Dijon : résistance aux carbapénèmes ou à la ceftazidime sur la période de 2018 à 2023

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

La dynamique en hausse de l’implication d’Achromobacter chez les patients du CHU associée à une méconnaissance de la distribution des mécanismes de résistance chez une bactérie pourtant fréquemment multirésistante justifie une étude plus approfondie. Ce projet s’inscrit dans une démarche descriptive concernant les infections à Achromobacter dans notre établissement, à savoir la résistance aux antibiotiques majeurs et les mécanismes impliqués, la distribution des espèces et des génotypes impliqués parmi les souches d’A. xylosoxidans, le nombre de patients concernés, les comorbidités dont l’immunodépression des patients, le contexte infectieux. La distribution des mécanismes impliqués dans la résistance acquise aux carbapénèmes et à la ceftazidime sera recherchée tout d’abord via des séquençages de génomes, permettant de repérer des gènes codant par exemple pour des carbapénémases acquises telles que l’IMP19 ou des mutations dans des régulateurs de systèmes d’efflux. En fonction des résultats des mesures d’expression de gènes d’intérêt seront réalisés par RT-qPCR (comme axyB, transporteur du système d’efflux AxyABM). Enfin des causes possibles de l’émergence de la bactérie et des souches résistantes pourront être explorées par une revue de dossiers pour repérer une exposition préalable aux antibiotiques et par du génotypage pour détecter des transmissions croisées et/ou des sources environnementales précédemment décrites.